Este es el comando bp_mrtransp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
bp_mrtrans: implementa un transformador de alineaciones de proteínas a coordenadas de mrna
SINOPSIS
Uso:
bp_mrtrans -i archivo de entrada -o archivo de salida [-if formato de entrada] [-of formato de salida] [-s cDNA
base de datos de secuencias] [-sf formato de secuencia de ADNc] [-h]
DESCRIPCIÓN
Esta secuencia de comandos convertirá una alineación de proteínas de nuevo en un ADNc. Vagamente basado en Bill
Mrtrans de Pearson.
Las opciones son:
-o nombre de archivo: el nombre del archivo de salida [STDOUT predeterminado]
-of formato - formato de secuencia de salida
(alineación de secuencia múltiple)
[phylip predeterminado]
-i nombre de archivo: el nombre del archivo de entrada [obligatorio]
-if formato - formato de secuencia de entrada
(alineación de secuencia múltiple)
[clustalw predeterminado]
-s --seqdb filename - el archivo de base de datos de secuencia de cDNA
-sf --seqformat - el formato cDNA seq db (formato de secuencia de archivo plano)
-h - este menú de ayuda
Utilice bp_mrtransp en línea utilizando los servicios de onworks.net
