Este es el comando cassiopee que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
cassiopee - página de manual para Cassiopee Versión 1.0
SINOPSIS
cassiopee [Opciones]
DESCRIPCIÓN
Uso:
-l: máxima profundidad de índice / tamaño máximo de patrón
-u: guardar el índice para su uso posterior
-s: secuencia para indexar
-p: patrón para buscar
-f: archivo que contiene el patrón para buscar
-o: archivo de salida
-r: aplicar reducción de árboles
-m: modo de búsqueda: 0 = ADN, 1 = ARN, 2 = Proteína
-a: permite la búsqueda de ambigüedad alfabética
-n: máximo de N coincidencias consecutivas permitidas en la búsqueda
-e: máxima sustitución permitida coincidencias en la búsqueda
-i: max indel coincidencias permitidas en la búsqueda
-g: genera un archivo de puntos del gráfico
-d: profundidad máxima del gráfico
-t: formato de salida: 0: tsv (predeterminado), 1: json
-x: posición mínima en secuencia
-y: posición máxima en secuencia
-v: mostrar versión
-h: muestra este mensaje
Use cassiopee en línea usando los servicios de onworks.net
