Este es el comando cmtk-reformatx que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
reformatx - reformateo de volumen
SINOPSIS
reformatx [opciones] - flotante flotanteImg objetivo x0 [x1 ...]
O reformatear [opciones] destino [x0 x1 ...] {-j, - jacobian} xx0 [xx1 ...]
O DONDE x0 ... xN y xx0 ... xxN es [{-i, - inversa}] transformación ##. (Si el primero
la transformación en la secuencia está invertida, entonces '--inverse' debe estar precedido por '-',
es decir, use '- --inverse xform.path').
DESCRIPCIÓN
Herramienta de reformateo de volumen extendida para calcular imágenes reformateadas y mapas jacobianos desde
secuencias arbitrarias de transformaciones concatenadas
CAMPUS
Buscar Kit de herramientas Opciones (estas en compartido by todos CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.
--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.
--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.
--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.
--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.
--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.
- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.
--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).
--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).
--Tipo de salida
Tipo de datos escalares para la imagen de salida. Valores admitidos: "char", "byte", "short",
"ushort", "int", "uint", "float", "double", o utilice uno de los siguientes:
--carbonizarse
8 bits, firmado
--byte
8 bits, sin firmar
--pequeño
16 bits, firmado
--corto
16 bits, sin firmar
--En t
32 bits firmados
--uint
32 bits sin firmar
--flotador
Punto flotante de 32 bits
--doble
Punto flotante de 64 bits
--rellenar con , -P
Valor de relleno para la imagen de salida [Defecto: 0]
Opciones para Natural Reformateo
--interpolación
Método de interpolación de imágenes. Valores admitidos: "linear", "nn", "cubic", "pv", "sinc-
coseno "," sinc-hamming ", donde el valor predeterminado es" lineal ", o utilice uno de los siguientes:
--lineal
Interpolación trilineal [Esta is las defecto]
--nn Interpolación del vecino más cercano
--cúbico
Interpolación tricúbica
--pv Interpolación de volumen parcial
--inc-coseno
Interpolación Sinc con ventana de coseno
--sinc-hamming
Interpolación Sinc con ventana de Hamming
- radio de ventana incl.
Radio de ventana para interpolación Sinc [Defecto: 3]
- preservar-masa
Reformateo de preservación masiva: multiplique cada valor reformateado con el jacobiano
determinante de la transformación aplicada.
Opciones para Jacobiano Mapa Reformateo
--jacobian-correcto-global
Corregir mapas jacobianos para escala global.
--no-jacobiano-correcto-global
No corrija los mapas jacobianos para la escala global. [Esta is las defecto]
Entrada Opciones
- cuadrícula de destino
Defina la cuadrícula de destino para reformatearla como Nx, Ny, Nz: dX, dY, dZ [: Ox, Oy, Oz]
(atenúa: píxel: desplazamiento)
--máscara, -m
Utilice los datos de píxeles de destino como máscara binaria.
--cultivo
Recortar imagen de destino: x0, y0, z0, x1, y1, z2
--desplazamiento de destino , -O
Anule el desplazamiento de la imagen de destino y establezca en x, y, z mm
--píxeles de compensación de destino
Anule el desplazamiento de la imagen de destino y configúrelo en píxeles dx, dy, dz
--flotante , -F
Formato y ruta de la imagen flotante. [Defecto: NINGUNO]
--pad-flotante
Valor de relleno para la imagen flotante [Defecto: discapacitado]
Salida Opciones
--archivo de salida , -o
Formato y ruta de la imagen de salida. [Defecto: reformatear.nii ]
Imagen / Transformación Base de datos
--db
Ruta a la base de datos de imagen / transformación que debe actualizarse con la nueva
imagen. [Defecto: NINGUNO]
AUTORES
Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko
Use cmtk-reformatx en línea usando los servicios de onworks.net
