Este es el comando cmtk-unwarp_image_phantom que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
unwarp_image_phantom: crea una transformación para deshacer una imagen basada en un fantasma
descripción
SINOPSIS
descomponer_imagen_fantasma Entrada Fantasma Entrada Imagen Salida Xform
DESCRIPCIÓN
Esta herramienta calcula una transformación polinomial o una deformación de forma libre B-spline para
desenrollar una imagen. La transformación se basa en hitos esperados y detectados en un
imagen de un fantasma estructural adquirida en el mismo escáner. Utilice el 'detect_adni_phantom'
herramienta para detectar puntos de referencia del ADNI Phantom en una imagen y generar un fantasma
archivo de descripción adecuado para su uso con esta herramienta.
CAMPUS
Buscar Kit de herramientas Opciones (estas en compartido by todos CMTK herramientas)
--ayuda
Escriba la lista de opciones básicas de la línea de comandos en la salida estándar.
--ayudar a todo
Escriba una lista completa de opciones de línea de comandos básicas y avanzadas en la salida estándar.
--wiki
Escriba la lista de opciones de la línea de comandos en la salida estándar en el marcado de MediaWiki.
--hombre
Escriba el código fuente de la página man con el marcado 'nroff' en la salida estándar.
--versión
Escriba la versión del kit de herramientas en la salida estándar.
--eco
Escribe la línea de comando actual en la salida estándar.
- nivel de verbo
Establecer el nivel de verbosidad.
--verboso, -v
Incrementar el nivel de verbosidad en 1 (obsoleto; admitido por compatibilidad con versiones anteriores).
--hilos
Establezca el número máximo de subprocesos paralelos (para subprocesos POSIX y OpenMP).
Fitting Opciones
--ajuste-inverso
Ajustar transformación inversa (mapeo de ubicaciones de hitos reales a esperadas). Este es
útil para calcular un mapa de corrección de volumen jacobiano (usando 'reformatx') sin
tener que invertir numéricamente la transformación unwarping ajustada.
--ajustar hacia adelante
Adaptar la transformación hacia adelante (mapeo esperado de ubicaciones de puntos de referencia reales). Este es
útil para rectificar la imagen mediante el rebanado (usando 'reformatx'). [Esta is las
defecto]
fexibles
--ranura
Ajuste la deformación de forma libre B-spline.
--escuela politécnica
Ajustar transformación polinomial. [Esta is las defecto]
Polinomio Fitting Opciones (con --escuela politécnica)
--la licenciatura
Grado de la transformación polinomial ajustada. [Defecto: 4]
B-Splines Fitting Opciones (con --ranura)
- espaciado-cp-final
Espaciado de cuadrícula de puntos de control final de la transformación B-spline de salida. [Defecto: 0]
--final-cp-dimensiones
Dimensiones finales de la cuadrícula de puntos de control (es decir, número de puntos de control) de la salida B-
transformación spline. Se proporcionará como 'dimX, dimY, dimZ'. [Defecto: NINGUNO]
--niveles
Número de niveles en el procedimiento de aproximación B-spline multinivel. [Defecto: 1]
--iteraciones por nivel
Número máximo de iteraciones de actualización del coeficiente de spline por nivel en el multinivel
Procedimiento de aproximación B-spline. [Defecto: 100]
--rms-umbral
Umbral de mejora relativa del residual de ajuste RMS. La iteración de ajuste
termina si (rmsAfterUpdate-rmsBeforeUpdate) / rmsBeforeUpdate <umbral.
[Defecto: 0]
--no-apto-afín
Deshabilite el ajuste de la transformación afín para inicializar la spline. En su lugar, ajuste spline
directamente. Esto suele dar peores resultados y se desaconseja.
AUTORES
Torsten Rohlfing, con contribuciones de Michael P. Hasak, Greg Jefferis, Calvin R.
Maurer, Daniel B. Russakoff y Yaroslav Halchenko
Use cmtk-unwarp_image_phantom en línea usando los servicios de onworks.net
