Este es el comando coils-wrap que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
coils-wrap - ejecuta ncoils tres veces para darle una salida de tres ventanas
SINOPSIS
envoltura de bobinas [OPCIÓN]
DESCRIPCIÓN
coils-wrap ejecuta ncoils tres veces para darle una salida de tres ventanas.
ncoils es un programa que compara una secuencia con una base de datos de dos cadenas paralelas conocidas
bobinas en espiral y obtiene una puntuación de similitud. Comparando esta puntuación con la distribución
de puntuaciones en proteínas globulares y en espiral, el programa calcula la
probabilidad de que la secuencia adopte una conformación de espiral.
CAMPUS
-i archivo de entrada en formato FASTA
-o archivo de salida
-r archivo de salida sin formato, predeterminado: ` _crudo'
-m tipo de matriz; conjunto de matriz (MTK o MTIDK)
-w peso a & d = b, c, e, f & g (booleano)
EJEMPLOS
"envoltura de bobinas -m MTIDK -i /usr/share/doc/ncoils/1srya.fa -o /tmp/coils.out -r
/tmp/coils_raw.txt && menos /tmp/coils.out /tmp/coils_raw.txt "
"ncoils -win 14 </usr/share/doc/ncoils/1srya.fa"
Use coils-wrap en línea usando los servicios de onworks.net
