Este es el comando EDTSurf que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
EDTSurf: construcción rápida y precisa de superficies macromoleculares
SINOPSIS
EDTSurf -i pdbname...
DESCRIPCIÓN
EDTSurf es un programa de código abierto para construir superficies trianguladas para macromoléculas. Eso
genera tres superficies macromoleculares principales: superficie de van der Waals, accesible a disolventes
superficie y superficie molecular (superficie sin disolvente). EDTsurf también identifica caries
que están dentro de las macromoléculas.
CAMPUS
-o sobrenombre
-t 1-MC 2-VCMC
-s 1-VWS 2-SAS 3-MS 4-SES
-c 1-puro 2-átomo 3-cadena
-p radio de la sonda [0,2.0]
-f factor de escala (0,20.0]
-h 1 entrada y salida 2 salidas 3 entradas
salida1: outname.ply
salida2: outname.asa
salida3: nombre-salida-cav.pdb
Utilice EDTSurf en línea utilizando los servicios de onworks.net