Este es el comando fastaq-trim_contigs que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fastaq_trim_contigs: recorta un número determinado de bases al final de cada contig
DESCRIPCIÓN
uso: fastaq_trim_contigs [opciones]
Recorta un número determinado de bases al final de cada contig, por lo que los espacios se hacen más grandes y contig
se eliminan los extremos. Las bases se reemplazan por Ns. Cualquier secuencia que termine con todas las N se pierde
posicional argumentos:
infile Nombre del archivo de entrada
archivar
Nombre del archivo de salida
opcional argumentos:
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
--número_recortado TRIM_NUMBER
Número de bases para recortar alrededor de cada espacio y los extremos de cada secuencia [100]
Utilice fastaq-trim_contigs en línea utilizando los servicios de onworks.net