Este es el comando fdnadiste que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fdnadist - Programa de matriz de distancia de secuencia de ácido nucleico
SINOPSIS
fdnadista -secuencia seqsetall -método lista -gama lista -categorías entero -Velocidad matriz
-categorías propiedades [-pesos propiedades] -gamacoeficiente flotar
-invarfrac flotar -tratio flotar -frecuencias de palanca -frecuencia base matriz
[-inferior booleano] [-humano legible booleano] -archivo de salida archivar [-imprimirdatos booleano]
[-Progreso booleano]
fdnadista -ayuda
DESCRIPCIÓN
fdnadista es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del (los) grupo (s) de comando "Filogenia: Secuencia molecular".
CAMPUS
Entrada .
-secuencia seqsetall
Archivo que contiene una o más alineaciones de secuencia
-método lista
Valor predeterminado: modelo de distancia F84
-gama lista
Valor predeterminado: no se utilizan parámetros de distribución
-categorías entero
Valor predeterminado: 1
-Velocidad matriz
Valor predeterminado: 1.0
-categorías propiedades
Archivo de categorías de tasas de sustitución
-pesos propiedades
Adicionales .
-gamacoeficiente flotar
Valor predeterminado: 1
-invarfrac flotar
Valor predeterminado: 0.0
-tratio flotar
Valor predeterminado: 2.0
-frecuencias de palanca
Valor predeterminado: Y
-frecuencia base matriz
Valor predeterminado: 0.25 0.25 0.25 0.25
-inferior booleano
Valor predeterminado: N
-humano legible booleano
Valor predeterminado: @ ($ (método) == s? Y: N)
Salida .
-archivo de salida archivar
-imprimirdatos booleano
Valor predeterminado: N
-Progreso booleano
Valor predeterminado: Y
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