Este es el comando gbseqget que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gbseqget - secuencias de formato de GenBank como un GBSet XML
SINOPSIS
gbseqget [-] [-d nombre de archivo] [-i nombre de archivo] [-m n / p / b] [-n] [-o nombre de archivo] [-v]
DESCRIPCIÓN
gbseqget recupera datos de secuencia biológica de GenBank (de acuerdo con una lista de entrada de GI
números de acceso) y lo imprime como un documento XML GBSet.
CAMPUS
Un resumen de las opciones se incluye a continuación.
- Mensaje de uso de impresión
-d nombre de archivo
Ingrese el nombre del archivo para la lista de fechas (accesiones deseadas, una por línea, seguida de una
línea en blanco y una lista de fechas permitidas, también una por línea)
-i nombre de archivo
Ingrese el nombre del archivo para la lista GI (predeterminado = stdin)
-m n / p / b
Tipo de molécula:
n Nucleótido (predeterminado)
p Proteína
b Ambos
-n Devolver solo registros nuevos (para los cuales la IG dada se refiere a una versión anterior)
-o nombre de archivo
Nombre del archivo de salida para XML GBSet (predeterminado = stdout)
-v Obtener variaciones de SNP
NOTAS
El formato GBSet está obsoleto en favor de INSDSet, que puede producir ejecutando
insdseqget en lugar de gbseqget.
Utilice gbseqget en línea utilizando los servicios de onworks.net
