Este es el comando gmod_sort_gff3.plp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gmod_sort_gff3.pl: ordena un archivo GFF3 para colocar líneas con etiquetas padre después de su padre.
SINOPSIS
% gmod_sort_gff3.pl --infile
LÍNEA DE COMANDO OPCIONES
--infile Nombre del archivo gff3 de entrada (obligatorio)
--outfile Nombre del archivo gff3 de salida
(predeterminado: sorted.gff)
DESCRIPCIÓN
Este es un script muy simple (y solo ligeramente probado) para ordenar archivos gff3 para que todos
las líneas que tienen etiquetas de padres vienen después de la línea que contiene la etiqueta de identificación de padres. Archivos
así ordenados son necesarios para el cargador a granel GMOD chado, gmod_bulk_load_gff3.pl.
AUTORES
Scott Cain[email protected]>
Copyright (c) 2006
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términos como el propio Perl.
Use gmod_sort_gff3.plp en línea usando los servicios de onworks.net
