Este es el comando gt-stat que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
gt-stat: muestra estadísticas sobre las funciones contenidas en los archivos GFF3.
SINOPSIS
gt stat [opción ...] [GFF3_file ...]
DESCRIPCIÓN
-genelengthdistri [si | no]
mostrar la distribución de la longitud de los genes (predeterminado: no)
-genescoredistri [si | no]
mostrar la distribución de la puntuación de genes (predeterminado: no)
-exonlengthdistri [si | no]
mostrar la distribución de la longitud del exón (predeterminado: no)
-exonnumberdistri [si | no]
mostrar la distribución del número de exón (predeterminado: no)
-intronlengthdistri [si | no]
mostrar la distribución de la longitud del intrón (predeterminado: no)
-cdslengthdistri [si | no]
mostrar la distribución de longitud de CDS (medida en aminoácidos) (predeterminado: no)
-Fuente [si | no]
muestra el conjunto de etiquetas de origen utilizadas (columna 2 en líneas GFF3 normales) (predeterminado: no)
-addintrones [si | no]
agregar características de intrón entre las características de exón existentes (antes de calcular las estadísticas) (predeterminado:
No)
-v [si | no]
ser detallado (predeterminado: no)
-o [nombre de archivo]
redirigir la salida al archivo especificado (predeterminado: indefinido)
-gzip [si | no]
escribir archivo de salida comprimido gzip (predeterminado: no)
-bzip2 [si | no]
escribir archivo de salida comprimido bzip2 (predeterminado: no)
-fuerza [si | no]
forzar la escritura en el archivo de salida (predeterminado: no)
-ayuda
mostrar ayuda y salir
-versión
mostrar información de la versión y salir
PRESENTACIÓN DE INFORMES LOCO
Informar errores a[email protected]>.
Use gt-stat en línea usando los servicios de onworks.net
