Este es el comando h5dump que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
h5dump: muestra el contenido del archivo HDF5.
SINOPSIS
archivo h5dump [OPTIONS]
DESCRIPCIÓN
h5dump permite al usuario examinar el contenido de un archivo HDF5 y volcar ese contenido,
en formato legible por humanos, a un archivo ASCII.
h5dump vuelca el contenido del archivo HDF5 a la salida estándar. Puede mostrar el contenido del
archivo HDF5 completo u objetos seleccionados, que pueden ser grupos, conjuntos de datos, un subconjunto de un
conjunto de datos, enlaces, atributos o tipos de datos.
La opción --header muestra solo la información del encabezado del objeto.
Los nombres son los nombres absolutos de los objetos. h5dump muestra los objetos en el mismo orden que
la orden de mando. Si un nombre no comienza con una barra, h5dump comienza a buscar el
objeto especificado comenzando en el grupo raíz.
Si un objeto está vinculado de forma rígida con varios nombres, h5dump muestra el contenido del objeto
en la primera aparición. Solo la información del enlace se muestra en sucesos posteriores.
h5dump asigna un nombre para cualquier tipo de datos sin nombre en la forma de # oid1: oid2, donde oid1 y
oid2 son los identificadores de objeto asignados por la biblioteca. Se muestran los tipos sin nombre
dentro del grupo raíz.
Los tipos de datos se muestran con nombres de tipos estándar. Por ejemplo, si se crea un conjunto de datos
con el tipo H5T_NATIVE_INT y el nombre de tipo estándar para el entero en esa máquina es
H5T_STD_I32BE, h5dump muestra H5T_STD_I32BE como el tipo de conjunto de datos.
h5dump también puede volcar un subconjunto de un conjunto de datos. Esta función funciona de la misma manera que
hiperslabs en HDF5; los parámetros especificados en la línea de comando se pasan a la función
H5Sselect_hyperslab y se muestra la selección resultante.
La salida de h5dump se describe en detalle en el DDL para HDF5, la descripción de datos
Documento de idioma.
Nota: No está permitido especificar varios atributos, conjuntos de datos, tipos de datos, grupos,
o enlaces suaves con una bandera. Por ejemplo, uno no puede emitir el comando
INCORRECTO: h5dump -a / attr1 / attr2 foo.h5
para mostrar tanto / attr1 como / attr2. Uno debe emitir el siguiente comando:
CORRECTO: h5dump -a / attr1 -a / attr2 foo.h5
Es posible seleccionar el controlador de archivo con el que abrir el archivo HDF5 usando el
--filedriver (-f) opción de línea de comandos. Los valores aceptables para la opción --filedriver son:
"sec2", "familia", "split", "multi" y "stream". Si no se especifica el indicador del controlador de archivo,
luego, el archivo se abrirá con cada controlador por turno y en el orden especificado anteriormente
hasta que un conductor logre abrir el archivo.
XML SALIDA
Con la opción --xml, h5dump genera una salida XML. Esta salida contiene un completo
descripción del archivo, marcado en XML. El XML se ajusta al tipo de documento HDF5
Definición (DTD) disponible en http://hdf.ncsa.uiuc.edu/DTDs/HDF5-File.dtd.
La salida XML es adecuada para su uso con otras herramientas, incluidas HDF5 Java Tools.
CAMPUS
-h or --ayuda Imprima un mensaje de uso y salga.
-B or - bloque de arranque Imprime el contenido del bloque de arranque. (Esta opción aún no está
implementado.)
-H or --encabezamiento Imprime solo el encabezado; no se muestran datos.
-A Imprime el encabezado y el valor de los atributos; no se muestran los datos de los conjuntos de datos.
-i or --identificadores de objetos Imprime los identificadores de objeto.
-r or --cuerda Imprime conjuntos de datos enteros de 1 bytes como ASCII.
-V or --versión Imprime el número de versión y sal.
-a P or - atributo = P Imprime el atributo especificado.
-d P or --dataset = P Imprime el conjunto de datos especificado.
-f D or --filedriver = D Especifique con qué controlador abrir el archivo.
-g P or --grupo = P Imprime el grupo especificado y todos los miembros.
-l P or - enlace suave = P Imprima los valores del enlace flexible especificado.
-o F or --salida = F Envíe los datos sin procesar al archivo F.
-t T or --datatype = T Imprime el tipo de datos con nombre especificado.
-w N or --ancho = N Establezca el número de columnas de salida.
-x or --xml XML de salida utilizando un esquema XML (predeterminado) en lugar de DDL.
-u or --uso-dtd Salida XML usando XML DTD en lugar de DDL.
-D U or --xml-dtd = U En la salida XML, consulte la DTD o el esquema en U en lugar de la
esquema / DTD predeterminado.
-X S or --xml-dns = S En la salida XML, (Esquema XML) utilice nombres calificados en XML: ":": no
espacio de nombres, predeterminado: "hdf5:"
-s L or --start = L Desplazamiento del inicio de la selección de subconjuntos. Predeterminado: el comienzo de la
conjunto de datos
-S L or - zancada = L Zancada de Hyperslab. Predeterminado: 1 en todas las dimensiones.
-c L or --contar = L Número de bloques a incluir en la selección.
-k L or --bloque = L Tamaño del bloque en hipereslabón. Predeterminado: 1 en todas las dimensiones.
-- Indique que todos los argumentos siguientes no son opciones. Por ejemplo, para volcar un archivo llamado
`-f ', use h5dump - -f.
presentar El archivo a examinar.
Los parámetros de opción enumerados anteriormente se definen de la siguiente manera:
D qué controlador de archivo utilizar para abrir el archivo. Los valores aceptables son "sec2",
"familia", "split", "multi" y "stream". Sin el controlador de archivo, marcar el archivo
se abrirá con cada conductor por turno y en el orden especificado anteriormente hasta que uno
el controlador logra abrir el archivo.
P La ruta completa desde el grupo raíz hasta el objeto
T El nombre del tipo de datos
F Un nombre de archivo
N Un número entero mayor que 1
L Una lista de números enteros, cuyo número es igual al número de dimensiones en el
espacio de datos que se está consultando
U Un URI (como se define en [IETF RFC 2396], actualizado por [IETF RFC 2732]) que hace referencia a
la DTD que se utilizará para validar el XML
Los parámetros de subconjunto también se pueden expresar en una forma compacta conveniente, de la siguiente manera:
--dataset = "/ foo / mydataset [START; STRIDE; COUNT; BLOCK]"
Todos los puntos y comas (;) son obligatorios, incluso cuando no se especifica un valor de parámetro. Cuando
no especificado, se utilizan los valores de parámetro predeterminados.
EJEMPLOS
1. Volcando el grupo / GroupFoo / GroupBar en el archivo quux.h5:
h5dump -g / GroupFoo / GroupBar quux.h5
2. Volcando el conjunto de datos Fnord en el grupo / GroupFoo / GroupBar en el archivo quux.h5:
h5dump -d / GroupFoo / GroupBar / Fnord quux.h5
3. Volcado de los metadatos de atributos del conjunto de datos Fnord que está en el grupo
/ GroupFoo / GroupBar en el archivo quux.h5:
h5dump -a / GroupFoo / GroupBar / Fnord / metadata quux.h5
4. Volcado de los metadatos del atributo, que es un atributo del grupo raíz en el archivo.
quux.h5:
h5dump -a / metadata quux.h5
5. Producir una lista XML del archivo bobo.h5:
h5dump --xml bobo.h5> bobo.h5.xml
6. Volcado de un subconjunto del conjunto de datos / GroupFoo / databar / en el archivo quux.h5
h5dump -d / GroupFoo / databar --start = "1,1" --stride = "2,3" --count = "3,19"
--block = "1,1" quux.h5
7. El mismo ejemplo que utiliza la forma abreviada para especificar los parámetros de subconjunto:
h5dump -d "/ GroupFoo / databar [1,1; 2,3; 3,19; 1,1]" quux.h5
CORRIENTE ESTADO
La versión actual de h5dump muestra la siguiente información:
* Grupo
o atributo de grupo (ver Atributo)
o miembro del grupo
* Conjunto de datos
o atributo del conjunto de datos (ver Atributo)
o tipo de conjunto de datos (ver Tipo de datos)
o espacio de conjunto de datos (ver Dataspace)
o datos del conjunto de datos
* Atributo
o tipo de atributo (ver Tipo de datos)
o espacio de atributos (ver Dataspace)
o datos de atributos
* Tipo de datos
o tipo entero
-H5T_STD_I8BE, H5T_STD_I8LE, H5T_STD_I16BE,...
o tipo de coma flotante
-H5T_IEEE_F32BE, H5T_IEEE_F32LE, H5T_IEEE_F64BE,...
o tipo de cuerda
o tipo compuesto
- tipo compuesto con nombre, sin nombre y transitorio - entero, flotante o
miembro de tipo de cadena
o tipos opacos
o tipo de referencia
- referencias de objeto
- regiones de datos
o tipo de enumeración
o tipos de datos de longitud variable
- solo tipos atómicos
- matriz escalar o unidimensional de tipos de longitud variable
apoyadas
* Espacio de datos
o espacio escalar y simple
* Enlace suave
* Enlace duro
* Detección de lazo
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