Este es el comando insdseqget que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
insdseqget - secuencias de formato de GenBank como un XML INSDSet
SINOPSIS
insdseqget [-] [-d nombre de archivo] [-i nombre de archivo] [-m n / p / b] [-n] [-o nombre de archivo] [-v]
DESCRIPCIÓN
insdseqget recupera datos de secuencia biológica de GenBank (de acuerdo con una lista de entrada de
Números de acceso GI) y lo imprime como un documento XML INSDSet.
CAMPUS
Un resumen de las opciones se incluye a continuación.
- Mensaje de uso de impresión
-d nombre de archivo
Ingrese el nombre del archivo para la lista de fechas (accesiones deseadas, una por línea, seguida de una
línea en blanco y una lista de fechas permitidas, también una por línea)
-i nombre de archivo
Ingrese el nombre del archivo para la lista GI (predeterminado = stdin)
-m n / p / b
Tipo de molécula:
n Nucleótido (predeterminado)
p Proteína
b Ambos
-n Devolver solo registros nuevos (para los cuales la IG dada se refiere a una versión anterior)
-o nombre de archivo
Nombre del archivo de salida para XML INSDSet (predeterminado = stdout)
-v Obtener variaciones de SNP
Use insdseqget en línea usando los servicios de onworks.net
