Este es el comando kraken-mpa-report que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
kraken-mpa-report: asignación de etiquetas taxonómicas a secuencias cortas de ADN
SINOPSIS
informe-kraken-mpa [--db KRAKEN_DB_NOMBRE] [opciones] <kraken salida archivo (s)>
CAMPUS
--db NOMBRE
Nombre de la base de datos de Kraken (predeterminado: ninguno)
--mostrar ceros
Mostrar taxones incluso si carecen de una lectura en alguna muestra
--línea de cabecera
Mostrar una línea de encabezado que indique los ID de muestra (los ID de muestra son los nombres de archivo)
- rangos intermedios
Mostrar taxones que no están en los rangos estándar con el prefijo x__
Use kraken-mpa-report en línea usando los servicios de onworks.net