Este es el comando maf-convert que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
maf-convert: convierte alineaciones en formato MAF a formato tabular
DESCRIPCIÓN
Uso:
maf-convertir --ayuda maf-convert axt mafFile (s) maf-convert blast mafFile (s)
maf-convert blasttab mafFile (s) maf-convert html mafFile (s) maf-convert psl
mafFile (s) maf-convert sam mafFile (s) maf-convert tab mafFile (s)
Lea alineaciones en formato MAF y escríbalas en otro formato.
OPCIONES
-h, --ayuda
mostrar este mensaje de ayuda y salir
-p, --proteína
asumir alineaciones de proteínas, para recuentos de coincidencias psl
-n, --sin encabezado
omitir cualquier línea de encabezado de la salida
-d, --diccionario
incluir diccionario de longitudes de secuencia en formato sam
-f DICTARCHIVO, --dictfile=DICTARCHIVO
obtener el diccionario de secuencia de DICTFILE
-r GRUPO DE LECTURA, --grupo de lectura=GRUPO DE LECTURA
leer información de grupo para formato sam
-l TAMAÑO DE LÍNEA, --tamaño de línea=TAMAÑO DE LÍNEA
longitud de línea para formatos blast y html (predeterminado: 60)
Use maf-convert en línea usando los servicios de onworks.net
