Este es el comando mergere que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
fusión: fusiona dos secuencias superpuestas
SINOPSIS
fusión -una secuencia secuencia -bsecuencia secuencia [-archivo de datos matrizf] [-brecha flotar]
[-gape extender flotar] -archivo de salida alinear -outseq seguimiento
fusión -ayuda
DESCRIPCIÓN
fusión es un programa de línea de comandos de EMBOSS (“European Molecular Biology Open
Paquete de programas"). Es parte del grupo de mando "Alineación: Consenso".
CAMPUS
Entrada .
-una secuencia secuencia
-bsecuencia secuencia
-archivo de datos matrizf
Este es el archivo de matriz de puntuación que se utiliza al comparar secuencias. Por defecto es el
archivo 'EBLOSUM62' (para proteínas) o el archivo 'EDNAFULL' (para secuencias nucleicas). Estas
Los archivos se encuentran en el directorio "datos" de la instalación de EMBOSS.
Adicionales .
-brecha flotar
Valor predeterminado: @ ($ (acdprotein)? 50.0: 50.0)
-gape extender flotar
Valor predeterminado: @ ($ (acdprotein)? 5.0: 5.0)
Salida .
-archivo de salida alinear
-outseq seguimiento
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