Este es el comando mia-2dmyocard-icaseries que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
mia-2dmyocard-icaseries: ejecute un análisis ICA en una serie de imágenes 2D
SINOPSIS
mia-2dmyocard-icaseries -i [opciones]
DESCRIPCIÓN
mia-2dmyocard-icaseries Este programa se utiliza para ejecutar una ICA en una serie de miocardio
imágenes de perfusión dadas en un conjunto de segmentación con el fin de crear referencias sintéticas que
se puede utilizar para la corrección de movimiento mediante el registro de imágenes. Si el objetivo es ejecutar un
compensación de movimiento, entonces es mejor ejecutar mia-2dmyoica-nonrigid, ya que este programa es
esencialmente lo mismo sin los bits de registro.
CAMPUS
Archivo-IO
-i --in-file = (entrada, obligatorio); cuerda
conjunto de datos de perfusión de entrada
-r --references = (salida); cuerda
Base de nombre de archivo para las imágenes de referencia. El tipo de imagen y el esquema de numeración son
tomado de las imágenes de entrada.
-c --save-cropped = (salida); cuerda
guardar el conjunto recortado del conjunto original en este archivo, los archivos de imagen utilizarán
la raíz del nombre como base de nombre de archivo
--save-feature = (salida); cuerda
guardar las imágenes de características resultantes del ICA y algunas imágenes intermedias
utilizado para la segmentación RV-LV con el nombre de archivo dado en base a archivos PNG.
También guarde los coeficientes de la mejor mezcla inicial y final de IC
matriz.
Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales
--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor
-h --ayuda
imprime esta ayuda
-? --uso
imprimir una breve ayuda
--versión
imprima el número de versión y salga
ICA
-C - componentes = 0
Componentes ICA 0 = estimación automática Componentes ICA 0 = automático
estimación
--normalizar
CI normalizados
--sin franja
no quites la media de las curvas de mezcla
-s --segscale = 1.4
Segmentar y escalar el cuadro de recorte alrededor del segmento LV (0 = sin segmentación) y
escale el cuadro de cultivo alrededor del LV (0 = sin segmentación)
-k --skip = 0
omitir imágenes al comienzo de la serie, ya que son de otras
modalidades omitir imágenes al comienzo de la serie, ya que son de otras
modalidades
-m --max-ica-iter = 400
número máximo de iteraciones en ICA número máximo de iteraciones en ICA
-E --segmethod = características
Método de segmentación
pico delta - diferencia de las imágenes de mejora máxima
Características - imágenes destacadas
característica delta - diferencia de las imágenes de características
Procesamiento
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).
EJEMPLO
Evalúe las referencias sintéticas del conjunto segmento.set y guárdelas en refXXXX. ??? por
utilizando cinco componentes independientes y omitiendo 2 imágenes. Por defecto, un cuadro delimitador
alrededor del LV se segmentará y escalará en 1.4 y las imágenes recortadas se guardarán en
cropXXXX. ??? y se crea un conjunto de segmentación cropped.set. ¿El tipo de archivo de imagen ??? es
deducido de las imágenes de entrada en segmento.set.
mia-2dmyocard-icaseries -i segmento.set -r ref -o ref -k 2 -C 5
AUTOR (es)
Gert Wollny
DERECHOS DE AUTOR
Este software tiene Copyright (c) 1999-2015 Leipzig, Alemania y Madrid, España. Viene
con ABSOLUTAMENTE NINGUNA GARANTÍA y puede redistribuirlo bajo los términos de GNU
LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.
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