mia-3dgetslice: en línea en la nube

PROGRAMA:

NOMBRE

mia-3dgetslice: extrae cortes de una imagen 3D.

SINOPSIS

Mia-3dgetslice -i -o [opciones]

DESCRIPCIÓN

Mia-3dgetslice Este programa se utiliza para extraer cortes 2D de un conjunto de datos 3D y almacenarlos
en archivos separados. Los archivos de salida se numerarán de acuerdo con su índice de sector.

CAMPUS

-i --in-file = (entrada, obligatorio); io
imagen (s) de entrada que se filtrarán Para conocer los tipos de archivos admitidos, consulte
PLUGINS: 3dimage / io

-o --out-file = (salida, obligatorio); io
imagen (s) de salida. Si número! = 1, este se utiliza como nombre base y debe
se dará sin extensión ya que se basará en la opción '--type'.
Si número = 1, se utilizará este nombre de archivo exacto. Para archivo compatible
tipos ver PLUGINS: 2dimage / io

-t --type = png
tipo de archivo de salida para el número! = 1
Soportado valores están:( bmp, grupo de datos, dicom, exr, jpg, png, crudo,
tiff, ver )

-s --start = 0
número de segmento inicial número de segmento inicial

-n --number = 1
número de cortes (todos = 0) número de cortes (todos = 0)

--ndigits = 4
número mínimo de dígitos del nombre de archivo números (si n! = 1) número mínimo
de dígitos de los números de nombre de archivo (si n! = 1)

-d --dir = xy
dirección de corte (xy = axial, xz = coronal, yz = sagital)
xz - obtener corte xz (coronal)
yz - obtener rebanada yz (sagital)
xy - obtener corte xy (axial)

Ayuda & Info
-V --verbose = advertencia
verbosidad de la salida, imprimir mensajes de nivel dado y prioridades más altas.
Las prioridades admitidas que comienzan en el nivel más bajo son:
info - Mensajes de bajo nivel
rastrear - Seguimiento de llamadas a funciones
fallar - Informar fallas en las pruebas
advertencia - Advertencias
error - Informar errores
depurar - Salida de depuración
mensaje - Mensajes normales
fatal - Informar solo errores fatales

--derechos de autor
imprimir información de derechos de autor

-h --ayuda
imprime esta ayuda

-? --uso
imprimir una breve ayuda

--versión
imprima el número de versión y salga

Procesamiento
--threads = -1
Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, este número debe ser menor
o igual al número de núcleos de procesador lógico en la máquina. (-1:
estimación automática) .Número máximo de subprocesos a utilizar para el procesamiento, esto
El número debe ser menor o igual al número de núcleos de procesador lógico en
la máquina. (-1: estimación automática).

COMPLEMENTOS: 2dimage / io

bmp Soporte de entrada / salida de imagen 2D BMP

Extensiones de archivo reconocidas: .BMP, .bmp

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Io de imagen 2D para DICOM

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

exr un complemento io de 2dimage para imágenes OpenEXR

Extensiones de archivo reconocidas: .EXR, .exr

Tipos de elementos admitidos:
32 bits sin firmar, coma flotante de 32 bits

jpg un complemento io de 2dimage para imágenes en escala de grises jpeg

Extensiones de archivo reconocidas: .JPEG, .JPG, .jpeg, .jpg

Tipos de elementos admitidos:
sin firmar de 8 bits

png un complemento io de 2dimage para imágenes png

Extensiones de archivo reconocidas: .PNG, .png

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits sin firmar, 16 bits sin firmar

crudo Soporte de salida de imagen RAW 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .RAW, .raw

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

tif Soporte de entrada / salida de imagen TIFF 2D

Extensiones de archivo reconocidas: .TIF, .TIFF, .tif, .tiff

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, sin firmar de 8 bits, sin firmar de 16 bits, sin firmar de 32 bits

vista un complemento io de 2dimage para imágenes de vista

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

COMPLEMENTOS: 3dimage / io

analizar Analizar imagen 7.5

Extensiones de archivo reconocidas: .HDR, .hdr

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits firmados, 32 bits firmados, coma flotante 32 bits,
coma flotante de 64 bits

grupo de datos E / S virtual hacia y desde el grupo de datos interno

Extensiones de archivo reconocidas:. @

dicom Serie de imágenes Dicom en 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .DCM, .dcm

Tipos de elementos admitidos:
16 bits firmados, 16 bits sin firmar

hdf5 E / S de imagen HDF5 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .H5, .h5

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, flotantes
punto de 32 bits, punto flotante de 64 bits

inría Imagen INRIA

Extensiones de archivo reconocidas: .INR, .inr

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

mhd E / S de imagen MetaIO 3D utilizando la implementación VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .MHA, .MHD, .mha, .mhd

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

ingenioso E / S de imagen 1D NIFTI-3

Extensiones de archivo reconocidas: .NII, .nii

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bits sin firmar, 64 bits firmados, 64 bits sin firmar, coma flotante 32
bit, coma flotante 64 bit

vff Formato ráster VFF Sun

Extensiones de archivo reconocidas: .VFF, .vff

Tipos de elementos admitidos:
8 bits sin firmar, 16 bits con signo

vista Vista 3D

Extensiones de archivo reconocidas: .V, .VISTA, .v, .vista

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

vti Entrada y salida de imagen 3D VTK-XML (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTI, .vti

Tipos de elementos admitidos:
firmado de 8 bits, sin firmar de 8 bits, firmado de 16 bits, sin firmar de 16 bits, firmado de 32
bit, 32 bit sin signo, 32 bit de coma flotante, 64 bit de coma flotante

vtk Entrada y salida heredada de imágenes 3D VTK (experimental).

Extensiones de archivo reconocidas: .VTK, .VTKIMAGE, .vtk, .vtkimage

Tipos de elementos admitidos:
datos binarios, 8 bits con signo, 8 bits sin firmar, 16 bits con signo, 16 bits sin firmar,
32 bits firmados, 32 bits sin firmar, coma flotante 32 bits, coma flotante 64
poco

EJEMPLO

Almacene 5 cortes coronales comenzando en el corte 120 coronalXXXX.png de image.v.

mia-3dgetslice -i imagen.v -o coronal -t png -n 5 -s 120

AUTOR (es)

Gert Wollny

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LICENCIA PÚBLICA GENERAL Versión 3 (o posterior). Para obtener más información, ejecute el programa con el
opción '--copyright'.

Utilice mia-3dgetslice en línea utilizando los servicios de onworks.net