Este es el comando minccmp que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas, como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
minccmp: compara uno o más archivos minc utilizando operadores de comparación
SINOPSIS
minccmp [ ] [ ...]
DESCRIPCIÓN
minccmp calculará medidas estadísticas simples entre dos archivos minc o más por
comparando todos los archivos posteriores con el primero. Los resultados para cada archivo subsecuente son luego
devuelto en orden. De forma predeterminada, se calculan todas las estadísticas. Si las estadísticas específicas son
solicitado a través de una opción de línea de comandos, sólo se imprimen las estadísticas solicitadas.
Una característica muy útil de este programa es la capacidad de restringir el conjunto de vóxeles
incluido en el cálculo estadístico, ya sea restringiendo el rango de valores incluidos
(-floor, -ceil o -range), o usando un archivo de máscara (-mask) con un rango restringido.
Las estadísticas de comparación disponibles en minccmp se dan a continuación. Tenga en cuenta que dos de estos
(-xcorr y -zscore) son una aproximación muy cercana a lo que se usa en minctracc.
CAMPUS
Tenga en cuenta que las opciones se pueden especificar en forma abreviada (siempre que sean únicas) y
se puede dar en cualquier lugar de la línea de comando.
General opciones
-golpear
Sobrescribe un archivo existente.
-noclobber
No sobrescriba un archivo existente (predeterminado).
-depurar Descarga mucha información adicional (para cuando las cosas se vuelvan locas).
-verboso
Imprime información adicional (más que la predeterminada).
-tranquilo Imprima solo los números solicitados
-max_buffer_size_in_kb tamaño
Especifique el tamaño máximo de los búferes internos (en kbytes). El valor predeterminado es 4 MB.
-verificar_dimensiones
Compruebe que todos los archivos de entrada tengan un muestreo coincidente en las dimensiones mundiales (predeterminado).
-nocheck_dimensiones
Ignore las diferencias en el muestreo de dimensiones mundiales para los archivos de entrada.
Volumen distancia opciones
-piso min
Un límite inferior para los rangos de datos que se incluirán en los cálculos estadísticos.
-hacer techo max
Un límite superior para los rangos de datos que se incluirán en los cálculos estadísticos.
-rango min,max
Un límite inferior y superior para los rangos de datos que se incluirán en las estadísticas.
-máscara nombre de archivo.mnc
Nombre del archivo que se utilizará para enmascarar los datos incluidos en los cálculos estadísticos.
Basic statistics
-todas Calcule todas las medidas estadísticas. Este es el predeterminado.
-ssq Imprima la diferencia de suma al cuadrado entre dos archivos de entrada
SSQ = Suma ((AB) ^ 2)
-rmse Imprima el error cuadrático medio de la raíz entre dos archivos de entrada
RMSE = raíz cuadrada (1 / n * Suma ((AB) ^ 2))
-xcorr Imprima la correlación cruzada entre dos archivos de entrada
XCORR = Suma ((A * B) ^ 2) / (sqrt (Suma (A ^ 2)) * sqrt (Suma (B ^ 2))
-zpuntuación
Imprima la diferencia de puntuación z entre dos archivos de entrada
ZSCORE = Suma (| ((A - media (A)) / stdev (A)) -
((B - media (B)) / stdev (B)) | ) / n
-semejanza
Calcule la matriz de confusión, asumiendo que los valores de volumen representan un
clase discreta de valores posibles. El valor máximo de etiqueta está limitado actualmente a
diez (10). Imprime la estadística de similitud de Dice, así como la especificidad, la sensibilidad,
precisión y kappa para cada clase y para los volúmenes totales.
Generic opciones para todos comandos:
-ayuda Imprima un resumen de las opciones de la línea de comandos y salga.
-versión
Imprima el número de versión del programa y salga.
Use minccmp en línea usando los servicios de onworks.net
