Este es el comando pymvpa2-prep-fmri que se puede ejecutar en el proveedor de alojamiento gratuito de OnWorks utilizando una de nuestras múltiples estaciones de trabajo en línea gratuitas como Ubuntu Online, Fedora Online, emulador en línea de Windows o emulador en línea de MAC OS.
PROGRAMA:
NOMBRE
pymvpa2-prep-fmri - preprocesar datos de fMRI para PyMVPA
SINOPSIS
pymvpa2-preparación-fmri [OPCIONES]
DESCRIPCIÓN
Pequeña herramienta para preparar un directorio para un análisis típico de datos de fMRI con PyMVPA. Instrumentos
de la suite FSL se utilizará para el preprocesamiento. Se necesita una serie temporal 4D fMRI como entrada
y realiza los siguientes pasos:
- extraer un volumen de ejemplo
- realizar la corrección de movimiento usando el volumen de ejemplo como referencia
- Generación conservadora de máscaras cerebrales y de extracción de calaveras
- enmascaramiento de la serie temporal con corrección de movimiento con la máscara cerebral
Todos los resultados se almacenarán en el directorio actual o en un subdirectorio con la
ID del sujeto (si se especifica).
OPCIONES
--versión
mostrar el número de versión del programa y salir
-v VERBOSO, --verboso=VERBOSO, --verbosidad=VERBOSO
Nivel de verbosidad de la salida [Predeterminado: 0]
-h, --ayuda, --llamada de socorro
Muestre este mensaje de ayuda y salga
-s SUJETO, --identificación del sujeto=ASUNTO
ID del sujeto utilizado como ruta de salida
-e EXFUNCIÓN, --ejemplo-func-vol=EXFUNCIÓN
Volumen (ID numérico o 'último', 'primero', 'medio') para usar como ejemplo
imagen funcional. Predeterminado: 10
-m MCFLIRT_OPTS, --mcflirt-opciones=MCFLIRT_OPTS
Opciones para MCFLIRT. '-plots' se agrega automáticamente
-p, --mcflirt-parcelas
Cree un .pdf con gráficos de parámetros de movimiento
-b APUESTA_OPTS, - opciones de apuesta=APUESTA_OPTS
Opciones para APUESTA. '-m' se agrega automáticamente. Predeterminado: '-f 0.3' para una suposición segura del
contorno del cerebro
Use pymvpa2-prep-fmri en línea usando los servicios de onworks.net
