Esta es la aplicación de Linux llamada BADASS cuya última versión se puede descargar como badass.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada BADASS con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
BADASS
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DESCRIPCIÓN
BADASS es un software con una interfaz gráfica fácil de usar que se aplica a la búsqueda y el análisis de la diversidad de bacteriocinas en datos de secuenciación de escopeta de metagenoma completo. La búsqueda de secuencias de bacteriocinas se realiza con herramientas como BLAST o DIAMOND utilizando como referencia la base de datos BAGEL4. Las supuestas secuencias de bacteriocinas identificadas se utilizan para determinar la abundancia y riqueza de las tres clases descritas hasta ahora. La abundancia se calcula comparando las lecturas identificadas como bacteriocinas con las lecturas identificadas como gen 16S rRNA utilizando la base de datos SILVA como referencia. El usuario puede cambiar los parámetros principales del análisis en la interfaz gráfica.
Caracteristicas
- La versión badass_v1.2 brinda la posibilidad de ejecutar MAC y Windows. Además de Linux.
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/badass/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
