Esta es la aplicación de Linux llamada BIGSdb cuya última versión se puede descargar como bigsdb_1.24.1.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada BIGSdb con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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GRANDESdb
DESCRIPCIÓN
La base de datos de secuencias de genomas aislados bacterianos (BIGSdb) es un sistema de base de datos escalable y accesible en la web diseñado para almacenar y analizar información fenotípica y genotípica vinculada de una manera computacionalmente eficiente. Los datos de secuencia pueden variar desde lecturas de secuencia única hasta múltiples contigs generados por tecnologías de secuenciación del genoma completo. El sistema incorpora la capacidad de definir e identificar cualquier número de loci y variantes genéticas en esos loci dentro de las secuencias de nucleótidos almacenadas. Estos loci pueden organizarse además en esquemas para la caracterización de aislamientos o para análisis evolutivos o funcionales.Véase Jolley y Maiden 2010, BMC Bioinformatics 11: 595 (http://www.biomedcentral.com/1471-2105/11/595).
Puede informar errores o realizar solicitudes de mejora utilizando el rastreador de problemas en https://github.com/kjolley/BIGSdb. El código fuente también se refleja allí.
Audiencia
Ciencia / Investigación, Usuarios finales avanzados, Desarrolladores
Interfaz de usuario
Basado en la Web
Lenguaje de programación
Perl, JavaScript
Entorno de base de datos
PostgreSQL (pgsql)
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/bigsdb/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
