Esta es la aplicación de Linux llamada CollagenFinder cuya última versión se puede descargar como CollagenFinder.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada CollagenFinder con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Buscador de colágeno
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DESCRIPCIÓN
CollagenFinder (CF) es una herramienta de software para buscar secuencias CLP en la secuencia de nucleótidos dada. CF escanea la secuencia de nucleótidos en los seis marcos de lectura posibles. Los procedimientos de filtro adicionales proporcionan una predicción de CLP más precisa:
- detectar un residuo de triptófano y codones de parada y eliminar los CLP correspondientes,
- valor de corte por número de repetición GXY. Si necesitamos CLP con una longitud de 36 y más, debemos usar un valor de corte igual a 4.
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Perl
Entorno de base de datos
Perl DBI / DBD
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/collagenfinder/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
