Esta es la aplicación de Linux llamada CUSHAW2: Parallel Gapped Read Alignment, cuya última versión se puede descargar como cushaw2-v2.1.11.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada CUSHAW2: Alineación de lectura separada en paralelo con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
CUSHAW2: Alineación de lectura con huecos paralelos
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DESCRIPCIÓN
CUSHAW2 es una alineación de lectura con huecos rápidos y paralelos para genomas grandes, como el genoma humano. La evaluación de rendimiento, al alinear conjuntos de datos simulados y reales con el genoma humano, muestra que CUSHAW2 se encuentra constantemente entre los alineadores mejor clasificados en términos de calidad de alineación tanto para la alineación de un solo extremo como para la alineación de extremos emparejados, al tiempo que demuestra una velocidad altamente competitiva. Además, nuestro alineador muestra una buena escalabilidad en paralelo con respecto al número de subprocesos de la CPU.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C + +
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/cushaw2/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
