Esta es la aplicación de Linux llamada FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como ffp-3.19.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada FFP-Feature Frequency Profile Phylogeny para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Filogenia de perfil de frecuencia de función FFP para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
FFP (Feature Frequency Profile) es una herramienta de comparación sin alineación para el análisis filogenético y la comparación de texto. Puede aplicarse a secuencias de nucleótidos, genomas completos, proteomas e incluso utilizarse para la comparación de textos.Caracteristicas
- Comparación de genomas, secuencias de proteínas y ácidos nucleicos en formato FASTA
- Salida de matriz de distancia de estilo phylip
- Más de una docena de medidas de distancia
- Utiliza un método de comparación sin alineación rápida
- Implementación de hash rápido de Rabin-Karp para el conteo de k-mer
- La función hash de enmascaramiento / semilla espaciada permite desajustes de ADN / aminoácidos
Público
Ciencia / Investigación, Educación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Perl, C
Entorno de base de datos
Archivo plano
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/ffp-phylogeny/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.