Esta es la aplicación de Linux llamada software GMATA para el marcador Genomic SSR cuya última versión se puede descargar como GMATAv2.2.jar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada software GMATA para el marcador Genomic SSR con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Software GMATA para marcador SSR Genomic
DESCRIPCIÓN
¿Qué es el software GMATA v21?
El análisis de microsatélites en todo el genoma hacia la aplicación (GMATA) es un software para análisis de repeticiones de secuencias simples (SSR) y diseño y mapeo de marcadores SSR en cualquier secuencia de ADN. Tiene las siguientes funciones:
1. minería SSR;
2. Análisis estadístico y trazado;
3. Visualización de gráficos de loci SSR;
4. Diseño de marcadores;
5. Investigación de cartografía electrónica y transferibilidad de marcadores.
GMATA es preciso, sensible y rápido. Fue diseñado para procesar grandes conjuntos de datos de secuencias genómicas, especialmente grandes secuencias del genoma completo. En teoría, GMATA puede analizar fácilmente genomas de cualquier tamaño. El software GMATA funciona en un servidor, una computadora de escritorio o incluso una computadora portátil, y puede ejecutarse en una interfaz gráfica con solo hacer clic o ejecutarse en la línea de comandos o en una tubería automatizada. También es multiplataforma y es compatible con Unix / Linux, Win y Mac. Los resultados del software GMATA se pueden mostrar directamente de forma gráfica con el genoma o las características del gen en Gbrowser y se pueden integrar fácilmente con cualquier base de datos genómica.
Caracteristicas
- Minería SSR precisa y más rápida en cualquier secuencia grande
- Análisis estadístico completo y trazado.
- Loci SSR y gráficos de marcadores que se muestran en Gbrowser con características del genoma
- Diseño de marcadores SSR específicos y PCR simulada
- Mapeo electrónico e investigación de transferibilidad de marcadores
- también disponible en https://github.com/XuewenWangUGA/GMATA.git
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/gmata/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
