Esta es la aplicación de Linux llamada Hamstr para ejecutarse en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como hamstr.v13.2.6-bin-lib.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Hamstr para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Hamstr para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
HaMStR se ha trasladado a https://github.com/bionf/hamstr donde ahora forma parte del paquete HaMStR-OneSeq.HaMStR es una herramienta basada en el modelo de Markov oculto de perfil para una búsqueda de ortólogos dirigida en EST o datos de secuencias de proteínas. El programa toma como entrada un grupo central predefinido de secuencias ortólogas (ortólogos centrales) y un conjunto de secuencias de un taxón de búsqueda. HaMStR luego combina en una estrategia de dos pasos una búsqueda basada en pHMM y una búsqueda inversa a través de BLAST para extender el grupo ortólogo central con secuencias novedosas del taxón de búsqueda.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/hamstr/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
