Esta es la aplicación de Linux llamada High-Throughput Tabular Data Processor cuya última versión se puede descargar como htdpinstaller.exe. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Procesador de datos tabulares de alto rendimiento con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Procesador de datos tabulares de alto rendimiento
DESCRIPCIÓN
El PROCESADOR DE DATOS TABULARES DE ALTO RENDIMIENTO (HTDP) es una aplicación Java que está destinada a facilitar la exploración de datos y las tareas de reducción en archivos de texto de gran tamaño resultantes de tecnologías de alto rendimiento, por ejemplo, secuenciación masivamente paralela o microarreglos. El software se ha optimizado para microarrays y datos de secuenciación paralela profunda, sin embargo, puede aceptar cualquier conjunto de datos tabulares delimitados por caracteres. HTDP también puede importar, procesar y convertir archivos de formato de llamada variante (VCF) ver. 4.0, 4.1 y 4.2 (http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.2.pdf).
HTDP proporciona una función de filtrado rápido y puede procesar datos que constan de archivos de entrada únicos o múltiples.
Cita: Madanecki P, Bałut M, Buckley PG, Ochocka JR, Bartoszewski R, Crossman DK, et al. (2018) Procesador de datos tabulares de alto rendimiento: herramienta gráfica independiente de la plataforma para procesar grandes conjuntos de datos. PLoS ONE 13 (2): e0192858. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0192858
Caracteristicas
- funciona en cualquier columna de datos delimitada por caracteres (por ejemplo, BED, GFF, GTF, WIG, VCF)
- fusionar archivos de datos tabulares vertical y horizontalmente
- fusionar cualquier archivo de datos tabulares utilizando la ubicación del genoma o columnas comunes
- capacidades ilimitadas de filtrado y reducción de datos
- Se pueden analizar diferentes archivos en cuanto a formato y contenido al mismo tiempo.
Lenguaje de programación
Java
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/htdp/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
