Esta es la aplicación de Linux llamada HMCan cuya última versión se puede descargar como HMCan.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada HMCan con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
HMCan
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DESCRIPCIÓN
HMCan es una herramienta basada en el modelo Hidden Markov que está desarrollada para detectar modificaciones de histonas en datos de ChIP-seq de cáncer. Aplica tres pasos de corrección a los datos: corrección del número de copias, corrección del sesgo de GC y corrección del nivel de ruido.
Para ejecutar HMCan, se necesita un archivo de alineación de destino ChIP-seq y un archivo de alineación de control. También se necesitan algunas configuraciones; para obtener más información, consulte el archivo README.
Autor: Haitham Ashoor
Contacto: Instituto Valentina Boeva Curie
Universidad de Ciencia y Tecnología Haitham Ashoor King Abdullah.
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/hmcan/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
