Esta es la aplicación de Linux llamada MARAGAP cuya última versión se puede descargar como Data-Maragap.rar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MARAGAP con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
MARAGAP
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DESCRIPCIÓN
Este artículo presenta "MARAGAP", un proceso de ensamblaje del genoma asistido de referencia. MARAGAP utiliza el principio de Longitud mínima de descripción para determinar la secuencia de referencia óptima para el ensamblaje. La secuencia de referencia óptima se utiliza como plantilla para inferir inversiones, inserciones, deleciones y SNP en el genoma objetivo. MARAGAP utiliza un enfoque algorítmico para detectar y corregir inversiones y deleciones, un enfoque basado en el gráfico De-Bruijn para inferir las inserciones, una herramienta de alineación local de brecha afín de coincidencia afín para estimar las ubicaciones de esas inserciones y un marco de estimación bayesiano para SNP.Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/refasp/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
