Esta es la aplicación de Linux llamada MendelChecker para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como MendelChecker_v2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MendelChecker para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
MendelChecker para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
MendelChecker es una medida basada en la probabilidad de segregación mendeliana de polimorfismos de nucleótido único (SNP) en genealogías nucleares. Desarrollamos este método como una medida de control de calidad para el descubrimiento de nuevas variantes a partir de datos de secuenciación ruidosos de próxima generación en genealogías, como la secuenciación de ADN asociada al sitio de restricción (RAD-seq) en organismos no modelo. Este método implementa la comparación de la transmisión heterogamética frente a la homogamética, es decir, la segregación ligada al sexo frente a la autosómica.Caracteristicas
- Medir la probabilidad de transmisión mendeliana en las genealogías
- Autosoma versus asignación de cromosomas sexuales
- Lee salida GATK estándar
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mendelchecker/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
