Esta es la aplicación de Linux llamada MiModD cuya última versión se puede descargar como MiModD-0.1.9.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada MiModD con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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MiModD
DESCRIPCIÓN
MiModD es un paquete de software para la identificación de variantes genómicas a partir de datos de secuenciación de próxima generación (NGS) con un uso optimizado de los recursos del sistema y una interfaz fácil de usar. Para la mayoría de los genomas de organismos modelo, permite al usuario realizar un análisis completo desde los datos de lectura de NGS genómicos no alineados hasta una lista anotada de variantes en una PC de escritorio normal en unas pocas horas. Su interfaz de usuario es fácil de usar para principiantes y está diseñada para alentar a los genetistas a analizar ellos mismos los datos de NGS sin la ayuda de un bioinformático capacitado.
Caracteristicas
- Análisis WGS de genomas de organismos modelo incluso en PC y portátiles individuales
- potentes herramientas para el filtrado y el mapeo de variantes
- integración en una instalación Galaxy existente con un solo comando
- conjuntos de datos de ejemplo para probar
- tutorial en línea y documentación extensa
- Distribuciones empaquetadas específicas de la plataforma (muchas versiones de Linux, OS X) para ejecutar y probar en una instancia Galaxy preconfigurada sin instalación
Audiencia
Ciencia / Investigación, Usuarios finales avanzados
Interfaz de usuario
Línea de comandos basada en web
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/mimodd/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
