Esta es la aplicación de Linux llamada Molecular Dynamics Studio cuya última versión se puede descargar como WindowsRelease.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Molecular Dynamics Studio con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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Estudio de dinámica molecular
DESCRIPCIÓN
Esta es una colección de modificaciones de software creadas para integrar NanoEngineer-1, PACKMOL y MSI2LMP con el propósito de crear fácilmente células de dinámica molecular. NanoEngineer-1 es un software CAD molecular escrito por Nanorex y proporciona al usuario una forma fácil de crear moléculas, mientras que las modificaciones del software permiten al usuario escribir átomos utilizando múltiples campos de fuerza. PACKMOL puede generar una colección aleatoria de moléculas utilizando las plantillas de moléculas de NanoEngineer-1, proporcionando así la célula MD inicial. Las modificaciones a PACKMOL permiten que los datos del tipo de átomo pasen al software MSI2LMP. MSI2LMP crea un archivo de entrada LAMMPS basado en campos de fuerza de clase I o clase II. MSI2LMP se modificó para utilizar datos de campo de fuerza codificados numéricamente generados por NanoEngineer-1. El formato de archivo MMP se amplió e integró en las tres aplicaciones de software.
http://www.nanoengineer-1.net
http://www.ime.unicamp.br/~martinez/packmol/
http://lammps.sandia.gov/
Caracteristicas
- Capacidad de CAD molecular a través de NanoEngineer-1
- Escriba manualmente átomos según el campo de fuerza atomista CFF91
- Cree plantillas de moléculas con NanoEngineer-1
- Genere una célula MD usando PACKMOL y múltiples plantillas de moléculas
- Genere un archivo de entrada de geometría LAMMPS usando MSI2LMP
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
OpenGL, Qt
Lenguaje de programación
Fortran, Python, C ++, C
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/moleculardynami/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
