Esta es la aplicación de Linux llamada oxDNA para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como oxDNA_2.4_RJUNE2019.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada oxDNA para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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oxDNA para ejecutar en Linux en línea
DESCRIPCIÓN
oxDNA es un código de simulación que se concibió inicialmente como una implementación del modelo de ADN de grano grueso introducido por TE Ouldridge, JPK Doye y AA Louis (http://dx.doi.org/10.1063/1.3552946). Desde entonces ha sido reelaborado y ahora es un marco extensible de simulación + análisis. Admite de forma nativa ADN, ARN, Lennard-Jones y simulaciones de partículas irregulares tanto en CPU como en GPU NVIDIA.Caracteristicas
- Dinámica molecular y browniana
- Monte Carlo (NVT, NPT, con o sin movimientos virtuales)
- Generador autónomo de hebra simple y doble
- Convertidor cadnano para origami de ADN
- Soporte para simulaciones de GPU NVIDIA
Audiencia
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C + +
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/oxdna/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.