Esta es la aplicación de Linux llamada parastructure cuya última versión se puede descargar como parastructure.0.9.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada parastructure con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
paraestructura
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DESCRIPCIÓN
parastructure es una colección de scripts de Perl para ejecutar el software de genética de poblaciones STRUCTURE de Pritchard et al. 2000 (http://pritch.bsd.uchicago.edu/structure.html) en paralelo en un grupo (tipo beowulf). Cada ejecución de K (el número de poblaciones) se ejecuta por separado en cada CPU del sistema de cola a través del clúster basado en PBS.
Una tabla de estadísticas resumidas y cifras de descomposición (Noah Rosenberg: http://www.stanford.edu/group/rosenberglab/distruct.html) se construyen al final de la ejecución.
También se proporciona un parche para la estructura (ran.c) para corregir la generación del número de semilla.
Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Lenguaje de programación
Shell de Unix, Perl, C
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/parastructure/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
