Esta es la aplicación de Linux llamada pipasic cuya última versión se puede descargar como README.txt. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada pipasic con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
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pipasico
DESCRIPCIÓN
El análisis metaproteómico permite estudiar la interacción de organismos o grupos funcionales y se ha vuelto cada vez más popular también para fines de diagnóstico. Sin embargo, surgen dificultades debido a la gran similitud de secuencia entre organismos relacionados. Además, el estado de conservación de las proteínas entre especies puede correlacionarse con su nivel de expresión, lo que puede conducir a un sesgo significativo en los resultados y la interpretación. Estos desafíos son similares pero no idénticos a los desafíos que surgen en el análisis de muestras metagenómicas y requieren soluciones específicas.
pipasic (corrección de similitud de abundancia de proteoma ponderada por intensidad de péptidos) es una herramienta que corrige los resultados de cuantificación basados en la identificación y el recuento espectral utilizando la estimación de similitud de péptidos y la ponderación del nivel de expresión dentro de un marco de lazo no negativo. pipasic tiene distintas ventajas sobre los enfoques solo con respecto a péptidos únicos o resultados de agregación al antepasado común más bajo.
Audiencia
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pipasic/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
