Esta es la aplicación de Linux llamada PolyCTLDesigner para ejecutar en Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como dist_PolyCTLDesigner.0.3.a.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada PolyCTLDesigner para ejecutar en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
PolyCTLDesigner para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
Dados los péptidos (epítopos de células T), PolyCTLDesigner selecciona secuencias flanqueantes para optimizar la unión de TAP y une los oligopéptidos resultantes en un poliepítopo de una manera que proporciona una liberación eficiente de epítopos potenciales mediante procesamiento proteasómico y / o inmunoproteasómico y minimiza el número de epítopos de unión. Para construir poliepítopos, PolyCTLDesigner utiliza patrones de aminoácidos conocidos de escisión del proteasoma y especificidad de unión a TAP. PolyCTLDesigner también puede elegir péptidos antigénicos que cubran el repertorio de HLA seleccionado con la tasa de redundancia deseada. Dadas las secuencias de antígenos, PolyCTLDesigner también puede seleccionar epítopos T auxiliares. Para predecir los epítopos de las células T, utiliza TEpredict.Público
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
Python
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/polyctldesigner/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
