Esta es la aplicación para Linux llamada Read Analysis and Comparison Kit en Java, cuya última versión se puede descargar como rackJ.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Read Analysis n Comparison Kit en Java con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Leer el kit Analysis n Comparison en Java
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DESCRIPCIÓN
Además de los valores de RPKM (lecturas por Kbp por millón de lecturas), RACKJ calcula los recuentos de lecturas para exones y eventos de empalme. Al hacerlo, es factible comparar dos muestras e identificar genes con la diferencia más significativa en el nivel de exón (empalme).
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
java, perl
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/rackj/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.