Esta es la aplicación de Linux llamada Seal, cuya última versión se puede descargar como seal-0.4.0-rc2.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Seal with OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
Sello
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DESCRIPCIÓN
Seal es un kit de herramientas de análisis y alineación de lectura corta distribuido basado en Hadoop. Actualmente, Seal incluye herramientas para: demultiplexación de lectura, alineación de lectura, eliminación de lectura duplicada, clasificación de asignaciones de lectura y cálculo de estadísticas para la recalibración de la calidad de base empírica. Selle básculas, manejando fácilmente TB de datos.Caracteristicas
- alineación de lectura corta (basada en BWA)
- identificación de lectura duplicada
- ordenar asignaciones de lectura
- calcular tablas de recalibración de calidad de base empírica
- rápido, escalable, confiable (se ejecuta en Hadoop)
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/biodoop-seal/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
