Esta es la aplicación de Linux llamada SOAPsv para ejecutar en Linux en línea cuya última versión se puede descargar como AsmSV.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SOAPsv para ejecutarla en Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SOAPsv para ejecutar en Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
Este es un enfoque que complementa los métodos anteriores para la identificación confiable de variaciones estructurales homocigotas. Nuestro enfoque determina con precisión el genotipo y los puntos de corte en relación con un genoma de referencia basado en el ensamblaje de novo de los datos de secuenciación del analizador del genoma de Illumina. En este método, examinamos solo variaciones estructurales homocigotas porque la detección de variaciones estructurales heterocigotas requiere el ensamblaje de secuencias de haplotipos, lo que aún no es posible con los ensambladores existentes.Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
AWK, C ++, Perl, Unix Shell
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/soapsv/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
