Esta es la aplicación de Linux llamada SplitMEM cuya última versión se puede descargar como splitmem.1.0.tgz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SplitMEM con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
dividirMEM
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DESCRIPCIÓN
Con el auge de las tecnologías de secuenciación mejoradas, la genómica se está expandiendo desde un paradigma de referencia única por especie a un enfoque pangenómico más completo con múltiples individuos representados y analizados juntos. Aquí presentamos un nuevo algoritmo de tiempo y espacio O (n log n) llamado splitMEM, que construye directamente el gráfico de Bruijn comprimido para un pangenoma de longitud total n. Para lograr esta complejidad de tiempo, aumentamos el árbol de sufijos con saltos de sufijos, una nueva construcción que nos permite atravesar varios enlaces de sufijos en tiempo constante y usarlos para descomponer eficientemente coincidencias exactas máximas (MEM) durante un recorrido de árbol de sufijos.
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
C + +
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/splitmem/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
