Esta es la aplicación de Linux llamada SUPERmerge cuya última versión se puede descargar como SUPERmerge.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada SUPERmerge con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie el emulador en línea OnWorks Linux o Windows en línea o el emulador en línea MACOS desde este sitio web.
- 5. Desde el SO OnWorks Linux que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación, instálala y ejecútala.
SCREENSHOTS
Ad
SUPERmerger
DESCRIPCIÓN
SUPERmerge es un algoritmo de anotación y análisis de acumulación de lectura de ChIP-seq para investigar archivos de alineación (BAM) de conjuntos de datos de ChIP-seq de modificación de histonas difusas con dominios de cromatina amplios en un nivel de resolución de un solo par de bases. SUPERmerge permite la regulación flexible de una variedad de parámetros de acumulación de lectura, lo que revela cómo las islas de lectura se agregan en áreas de cobertura en todo el genoma y qué características de anotación se asignan dentro de las réplicas biológicas individuales. SUPERmerge es especialmente útil para investigar experimentos de ChIP-seq de tamaño de muestra bajo en los que las modificaciones de histonas epigenéticas (p. Ej., H3K9me1, H3K27me3) dan como resultado picos inherentemente amplios con un rango difuso de enriquecimiento de señales que abarca múltiples loci genómicos consecutivos y características anotadas.
Caracteristicas
- secuencia de chip
- epigenética
- bioinformática
- Biología Computacional
Público
Ciencia / Investigación
Lenguaje de programación
C
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/supermerge/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.