Esta es la aplicación de Windows llamada dataMAPPs para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea cuya última versión se puede descargar como dataMAPPs_3.2.7.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada dataMAPPs para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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dataMAPPs para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea
DESCRIPCIÓN
dataMAPPs permite el procesamiento rutinario y eficiente de datos de estudios de inmunogenicidad aplicando la tecnología peptidómica de MAPPs para detectar posibles epítopos MHCI- o MHC-II tal como los presentan las células dendríticas (DC).Cuenta con control de calidad de los datos sin procesar, normalización entre muestras / donantes y visualización de resultados en un estilo de mapa de calor (heatMAPP). El núcleo de dataMAPPs es una biblioteca R genérica que se puede adaptar a proyectos específicos mediante scripts de control dedicados que también permiten un recálculo reproducible de los resultados.
Consulte el archivo README para obtener instrucciones de instalación y uso. La documentación adicional se proporciona en formato PDF.
dataMAPPs se publica bajo licencia GPL por un equipo de científicos que trabaja para Hoffmann-La Roche AG en Basilea, Suiza. El software se proporciona tal cual, con suerte, para beneficiar a otros investigadores.
Publicación en preparación:
Steiner et al, 'Habilitación rutinaria de proteómicos peptídicos asociados a MHC-II (MAPP) para la evaluación de riesgos de inmunogenicidad inducida por fármacos'
Caracteristicas
- importación de datos de peptidómica (salida PEAKS, pero puede extenderse)
- control de calidad de datos extenso y exclusión de muestras por cortes definibles por el usuario
- procedimiento de normalización de 2 pasos dedicado para datos MAPP
- mapeo de péptidos a anticuerpos / proteínas diana
- agrupación de posiciones de mapeo de péptidos en regiones de epítopos de puntos calientes
- visualización de los resultados del mapeo como mapas de calor
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Consola / Terminal
Lenguaje de programación
B / R
Entorno de base de datos
Archivo plano
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/datamapps/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
