Esta es la aplicación de Windows llamada PRIMUS para ejecutarse en Windows en línea sobre Linux en línea, cuya última versión se puede descargar como URLtoLastestPRIMUSversion.txt. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada PRIMUS para ejecutarla en Windows en línea sobre Linux en línea con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
PRIMUS para ejecutar en Windows en línea sobre Linux en línea
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DESCRIPCIÓN
NUEVO: Descargue la nueva versión con Pedigree Reconstruction en primus.gs.washington.eduEsta versión está desactualizada e incompleta. Visite el nuevo sitio web para obtener la versión completa de PRIMUS.
Presentamos un método adaptado de la teoría de grafos que siempre identifica el conjunto máximo de individuos no relacionados en cualquier conjunto de datos y permite que los parámetros de ponderación se utilicen en la selección de muestras no relacionadas. PRIMUS lee estimaciones de IBD generadas por el usuario y genera el conjunto máximo posible de individuos no relacionados, dado un umbral específico de parentesco. También se puede utilizar información adicional para la selección preferencial de individuos. Por ejemplo, cuando hay dos conjuntos máximos de igual tamaño de individuos no relacionados en una red, PRIMUS puede seleccionar preferentemente el conjunto con más individuos afectados.
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Software relevante:
http://students.washington.edu/jeanm5/Simulate_IBD_Python.ta
Caracteristicas
- Identifica el conjunto máximo de individuos no relacionados de un conjunto de datos genéticos
- Agrupa las muestras en redes familiares
- Genera archivos .dot para visualizar redes familiares.
Audiencia
Industria de la salud, Ciencia / Investigación, Educación
Lenguaje de programación
Perl
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/primus-beta/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
