Esta es la aplicación de Windows llamada Pysimony cuya última versión se puede descargar como Pysimony.py. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Pysimony con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
psimonía
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DESCRIPCIÓN
ACTUALIZACIÓN: Después de algunas correcciones de errores, abandoné Pysimony por Javamony: https://sourceforge.net/projects/javamony/
Dada la belleza de Python, sé que algún día tendré que terminar Pysimony.
El primer intento de un estudiante en un programa de inferencia filogenética, escrito en el simplista pero elegante Python.
Pysimony lee un archivo FASTA (solo se acepta ATGC) especificado como su único argumento. Las pruebas básicas han demostrado que es lento, inexacto y definitivamente ineficiente. Un árbol poco probable que sea el más parsimonioso se imprime una vez completado en formato básico de árbol de Newick.
Como todas las partes del programa son el trabajo original de un programador principiante, esto puede representar uno de los peores enfoques para resolver el problema filogenético. Claramente he evitado la programación orientada a objetos.
Sin embargo, distribuyo esto imaginando que algún día podría ser un poco educativo o al menos proporcionar una risa por el patético intento que hace de reinventar la rueda.
Caracteristicas
- Calculadora de parsimonia defectuosa
- Lee archivos FASTA (solo ATGC)
- Árbol de salidas en formato Newick
- Modo simple simple
Audiencia
Ciencia / Investigación, Educación
Interfaz de usuario
Línea de comando
Lenguaje de programación
Python
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/pysimony/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
