Esta es la aplicación para Windows llamada Seurat, cuya última versión se puede descargar como Version5.3.0sourcecode.tar.gz. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada Seurat con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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Seurat
DESCRIPCIÓN
Seurat es un completo conjunto de herramientas de R para el análisis genómico de células individuales, presentado por el Laboratorio Satija del NYGC. Facilita el control de calidad, la normalización, la agrupación, la integración de datos multimodales (p. ej., scRNA-seq, espaciales, CITE-seq) y la visualización. Seurat v5 introduce flujos de trabajo escalables y compatibilidad con la transcriptómica espacial, de uso común en la investigación académica e industrial para estudios de células individuales.
Caracteristicas
- Tuberías de control de calidad y normalización para scRNA-seq
- Reducción dimensional, agrupamiento y anotación de tipos de células
- Integración entre muestras y modalidades
- Análisis y visualización transcriptómica espacial
- Maneja conjuntos de datos a gran escala de manera eficiente (escalabilidad v5)
- Amplias viñetas, tutoriales e integración con Bioconductor
Lenguaje de programación
R
Categorías
Esta aplicación también se puede descargar desde https://sourceforge.net/projects/seurat.mirror/. Está alojada en OnWorks para facilitar su ejecución en línea desde uno de nuestros sistemas operativos gratuitos.
