Esta es la aplicación de Windows llamada ShuffleFastaSeq cuya última versión se puede descargar como ShuffleFastaSeq.exe. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada ShuffleFastaSeq con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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AleatorioFastaSeq
DESCRIPCIÓN
ShuffleFastaSeq es una aplicación de formulario de Windows, escrita en C#, para mezclar secuencias con formato FASTA. La permutación aleatoria se obtiene usando una variación simple del algoritmo de Fisher-Yates implementado por Durstenfeld (https://en.wikipedia.org/wiki/Fisher%E2%80%93Yates_shuffle) ( Knuth DE. El arte de la programación informática: algoritmos seminuméricos. 3.ª ed. Boston: Addison-Wesley; 1997). El archivo de entrada contiene una o más secuencias en formato FASTA. Se puede configurar el número de barajes (n) para cada secuencia; por defecto, n es 100. El archivo de salida contiene n copias aleatorias en formato FASTA para cada secuencia de entrada.
Por ejemplo (n=3):
Fichero de entrada:
>a
ACGGT
>b
GCCCATTC
Archivo de salida:
>a
TCGAG
>a
CGAGT
>a
TGCGA
>b
CACTCCGT
>b
CCCGTATC
>b
CCTTCAGC
Público
Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Win32 (MS Windows)
Lenguaje de programación
C#
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener desde https://sourceforge.net/projects/shufflefastaseq/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarse online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
