Esta es la aplicación de Windows llamada TomoJ cuya última versión se puede descargar como TomoJ_Applications-2.8.1-jar-with-dependencies.jar. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada TomoJ con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
tomoj
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DESCRIPCIÓN
TomoJ es un complemento de ImageJ para la reconstrucción tomográfica.
Fue diseñado para tomografía electrónica, sin embargo, cualquier adquisición con haz paralelo debería funcionar.
TomoJ propone el preprocesamiento y el registro de series de tilt antes de las reconstrucciones 3D (WBP, ART, SIRT, OS-SART, compressed sensing).
TomoJ está escrito en Java, los cálculos son multiproceso y la reconstrucción se puede realizar en CPU o GPU (OpenCL).
el registro se describe en:
Journal of Structural Biology: X. 2020, Volumen 4. "Mejoras en la alineación de imágenes sin marcadores para tomografía electrónica" COS Sorzano et al. https://doi.org/10.1016/j.yjsbx.2020.100037.
BMC Bioinformática. 2009 de abril de 27; 10: 124. "Registro de imágenes sin marcadores de series de inclinación de tomografía electrónica". COS Sorzano y col.
La parte de reconstrucción se describió en:
BMC Bioinformática. 2007 6 de agosto; 8: 288. "TomoJ: software de tomografía para la reconstrucción tridimensional en microscopía electrónica de transmisión". Messaoudi C et al
Caracteristicas
- tomografía
- ImageJ
- Alineación de la serie de inclinación
- Reconstrucción 3D
- WBP
- EL ARTE
- SIRTE
- detección comprimida
Interfaz de usuario
Swing de Java
Lenguaje de programación
Java, Open CL
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/tomoj/. Se ha alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
