Esta es la aplicación para Windows llamada UniversalMer, cuya última versión se puede descargar como Universal-MerV2.0.0.zip. Se puede ejecutar en línea en el proveedor de alojamiento gratuito OnWorks para estaciones de trabajo.
Descargue y ejecute en línea esta aplicación llamada UniversalMer con OnWorks de forma gratuita.
Siga estas instrucciones para ejecutar esta aplicación:
- 1. Descargue esta aplicación en su PC.
- 2. Ingrese en nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 3. Cargue esta aplicación en dicho administrador de archivos.
- 4. Inicie cualquier emulador en línea de OS OnWorks desde este sitio web, pero mejor emulador en línea de Windows.
- 5. Desde el sistema operativo OnWorks Windows que acaba de iniciar, vaya a nuestro administrador de archivos https://www.onworks.net/myfiles.php?username=XXXXX con el nombre de usuario que desee.
- 6. Descarga la aplicación e instálala.
- 7. Descargue Wine desde los repositorios de software de sus distribuciones de Linux. Una vez instalada, puede hacer doble clic en la aplicación para ejecutarla con Wine. También puedes probar PlayOnLinux, una elegante interfaz sobre Wine que te ayudará a instalar programas y juegos populares de Windows.
Wine es una forma de ejecutar software de Windows en Linux, pero no requiere Windows. Wine es una capa de compatibilidad de Windows de código abierto que puede ejecutar programas de Windows directamente en cualquier escritorio de Linux. Esencialmente, Wine está tratando de volver a implementar una cantidad suficiente de Windows desde cero para poder ejecutar todas esas aplicaciones de Windows sin necesidad de Windows.
SCREENSHOTS
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UniversalMer
DESCRIPCIÓN
UniversalMer es una herramienta de conteo de k-meros para múltiples tamaños de k simultáneamente. Está disponible para secuencias de ADN, ARN y proteínas. El programa cuenta y resume la frecuencia exacta de todos los k-meros desde 1-mero hasta una longitud máxima definida por el usuario (kmax). El análisis del espectro de k-meros con múltiples valores de k se realiza en segundos. Este programa está diseñado para investigadores y científicos en bioinformática.
Caracteristicas
- Contando k-meros con múltiples valores de k a la vez.
- Contando 1-meros hasta el kmax especificado por el usuario.
- Contando k-meros grandes en tiempo práctico
- Admite límite k hasta cualquier tamaño
- Encontrar la longitud máxima de patrones repetidos
- Admite secuencias de ADN, secuencias de ARN y secuencias de proteínas.
- Tiempo de ejecución práctico y uso de memoria
- Muestra el espectro de 1-meros a kmax-meros en segundos
- Volcado de patrones de 1-meros a kmax-meros en cuestión de segundos
- Habilitar la configuración de la frecuencia mínima para el conteo
- Separación de k-meros singleton de k-meros repetidos
Audiencia
Ingeniería, Ciencia / Investigación
Interfaz de usuario
Línea de comandos, consola / terminal
Lenguaje de programación
C, C ++
Categorías
Esta es una aplicación que también se puede obtener de https://sourceforge.net/projects/universal-mer/. Ha sido alojado en OnWorks para poder ejecutarlo online de la forma más sencilla desde uno de nuestros Sistemas Operativos gratuitos.
