این دستور asn2fsa است که می تواند در ارائه دهنده هاست رایگان OnWorks با استفاده از یکی از چندین ایستگاه کاری آنلاین رایگان ما مانند Ubuntu Online، Fedora Online، شبیه ساز آنلاین ویندوز یا شبیه ساز آنلاین MAC OS اجرا شود.
برنامه:
نام
asn2fsa - تبدیل داده های توالی بیولوژیکی از ASN.1 به FASTA
خلاصه
asn2fsa [-] [-A ACC] [-D] [-E] [-H] [-L نام فایل] [-T] [-a نوع] [-b] [-c] [-d مسیر]
[-e N] [-f مسیر] [-g] [-h نام فایل] [-i نام فایل] [-k] [-l] [-m] [-o نام فایل] [-p مسیر]
[-q نام فایل] [-r] [-s] [-u] [-v نام فایل] [-x خ] [-z]
شرح
asn2fsa داده های توالی بیولوژیکی را از ASN.1 به FASTA تبدیل می کند.
OPTIONS
خلاصه ای از گزینه ها در زیر آمده است.
- پیام مصرف چاپ
-A ACC الحاق برای واکشی
-D از Dash برای Gap استفاده کنید
-E Seq-id های توسعه یافته
-H HTML گسترش می یابد
-L نام فایل
ورود به سیستم فایل
-T از Threads استفاده کنید
-a نوع
نوع ورودی ASN.1:
خودکار (پیش فرض)
z هر
e Sequ-entry
b Bioseq
s Bioseq-set
m Seq-submit
پردازش دسته ای t (مناسب برای نسخه های رسمی؛ تشخیص خودکار نوع خاص)
-b Bioseq-set باینری است
-c Bioseq-set فشرده است
-d مسیر
مسیر دسترسی به پایگاه داده ReadDB
-e N طول خط (به طور پیش فرض 70؛ ممکن است بین 10 تا 120 باشد)
-f مسیر
مسیر به داده های فهرست شده FASTA
-g شکاف های دلتا را به آن گسترش دهید Ns
-h نام فایل
نام فایل خروجی کش جزء دور
-i نام فایل
فایل ورودی تک (ورودی استاندارد به طور پیش فرض)
-k واکشی محلی
-l قطعات را از قبل قفل کنید
-m سبک اصلی برای دنباله‌های تقسیم‌بندی شده نزدیک
-o نام فایل
نام فایل خروجی نوکلئوتید
-p مسیر
مسیر فایل های ASN.1
-q نام فایل
نام فایل خروجی امتیاز کیفیت
-r واکشی از راه دور از NCBI
-s پیوند ژنومی دور برای نمرات کیفیت
-u بازگشت
-v نام فایل
نام فایل خروجی پروتئین
-x خ زیر رشته انتخاب فایل (.ent به طور پیش فرض) [رشته]
-z شکاف امتیاز کیفیت چاپ -1
با استفاده از خدمات onworks.net از asn2fsa آنلاین استفاده کنید
